Что Вы пытаетесь сделать? Что значит скрипты идут в calculate? Какие скрипты?

Хм, уже давно было. Вылечилось предварительным выпиливанием всего, что связано с утилитами calculate, и только потом установкой новых.

Попытаюсь вспомнить как обнаружился баг.
После обновления я перезагрузился и попытался залогиниться. получил ошибку (уже не помню в каких скриптах) помню, что в них включались файлы из /usr/lib/calculate которые попросту там не существовали, но были в /usr/lib/calculate_2_2 (уже не помню что за файлы).
Попытался перенести из одной в другой - получил ошибку, но уже в чем-то другом.

Какие версии утилит calculate установлены?

eix -c calculate

Версии были те, что с 10.4 шли в комплекте. Что сейчас:

eix -c calculate
garbage (:) at end of version '0.7.8:'
accepting version anyway
garbage (:) at end of version '0.1.0:'
accepting version anyway
garbage (:) at end of version '0.4.4:'
accepting version anyway
garbage (:) at end of version '1.0.90.1:'
accepting version anyway
garbage (:) at end of version '2.1.0_rc1:'
accepting version anyway
garbage (:) at end of version '2.5.3:'
accepting version anyway
[N] media-gfx/calculate-cds-themes [1] (9.9): The theme for Calculate Directory Server
[N] media-gfx/calculate-cld-themes [1] (9.9-r1): The theme for Calculate Linux Desktop KDE
[N] media-gfx/calculate-cldx-themes [1] (9.9-r2): The theme for Calculate Linux Desktop XFCE
[N] media-gfx/calculate-cls-themes [1] (9.9): The theme for Calculate Linux Scratch
[N] media-gfx/calculate-clsg-themes [1] (9.9): The theme for Calculate Linux Scratch GNOME
[N] net-im/calculate-ejabberd [1] (~2.0.5-r3): The Erlang Jabber Daemon
[D] sys-apps/calculate [1] (1.3.12-r4@27.01.2011 -> 1.3.11): Program for installation, building
[D] sys-apps/calculate-client [1] (2.2.8@29.01.2011 -> 2.1.14): The program of setting and stor the domain
[D] sys-apps/calculate-lib [1] (2.2.8-r1(2.2)@29.01.2011 -> 2.1.8): The library for Calculate 2
[N] sys-apps/calculate-server [1] (2.1.12): The program for configuring services Linux
[N] sys-fs/calculate-squashfs [1] (~2.6.28.10-r3(2.6.28.10)): Tool for creating compressed file
[I] sys-kernel/calculate-sources [1] (2.6.32.11(2.6.32.11)@03.04.2010): Full sources including for the 2.6 kernel tree
[1] "calculate" /var/lib/layman/calculate

Эмм, мне отвечать? А то в почту пришло, а здесь ничего.
Если это удалили, то неплохоб и в статусе темы не показывать, что последнее обновление 6 часов назад. А то я в некотором замешательстве. :)