http://www.calculate-linux.org/main/ru/system_update_guide

Вы также можете использовать автозамену настроек конфигурационных файлов программ при установке значения переменной cl_autoupdate_set в файле /etc/calculate/calculate.env:

calculate.env более не располагается в /etc/calculate/, нужно исправить или дополнить.