Есть такая директория как /etc/sudoers.d/
Если я правильно понимаю логику вещей - в нее помещается файлы аналогичного с /etc/sudoers формата, и при этом они абсолютно не будут конфликтовать друг с другом.
Почему бы не использовать её, оставляя основной конфиг в оригинальном состоянии, либо изменяя/обнуляя его по желанию?

Из этого обсуждения