После последней синхронизации (это обнаружилось чуть более недели назад) портейджа (и соответственно оверлея calculate) возникает следующая проблема с формированием профиля из стоковых (оригинальных) шаблонов:

ws01 ~ # cl-desktop guest
 * Template error: /var/lib/layman/calculate/profiles/templates/desktop/desktop/00-patch-2.2.28/gtk-3.0
Failed to delete the file: /home/guest/.config/gtk-3.0
 * Failed to apply user profile templates

Тот же вывод в gdm/kdm, но дополнительно после нажатия на "ОК":

failed on execute /usr/share/calculate/xdm/login.d/20desktop.

После повторного логина получаем полностью дефолтовую среду Gnome/KDE/XFCE (не "фирменную" calculate'овскую), местами поломанную.